Если ИП прекратил деятельность, то продажа использовавшегося в его предпринимательской деятельности имущества приводит к начислению НДФЛ
Это следует из письма Минфин от 30.04.2015 № 03-04-05/25298. Если физическое лицо к моменту продажи нежилого помещения, использовавшееся в предпринимательской деятельности, деятельность в качестве ИП прекращена, то доходы, полученные от продажи такого помещения, подлежат обложению НДФЛ в общеустановленном порядке. При этом на налогоплательщика возложена обязанность по самостоятельному исчислению и уплате налога, а также по представлению налоговой декларации в налоговый орган по месту своего учета.
При этом льгота по освобождению от НДФЛ в случае продажи имущества, принадлежавшего физическому лицу на праве собственности более трех лет, не действует в отношении имущества, используемого в предпринимательской деятельности.